Dnem 29. srpna 1993 se stal Kostel Svatého Šimona A Judy jedním z nejvýznamnějších prostorů pro pořádání abonentních koncertů komorní hudby Koncertního jednatelství FOK, dalších institucí a pražského hudebního života vůbec. Kostel sv. Šimona a Judy je využíván i pro doprovodné akce, výstavy, audio a video nahrávání, rozhlasové a televizní přenosy. Při mimořádných příležitostech jsou organizovány vlastivědné či umělecko-historické prohlídky.
V roce 2020 Kostel Svatého Šimona A Judy odkoupilo Hlavní město Praha a v roce 2021 svěřilo Symfonickému orchestru hl. m. Prahy FOK.
Hlavní koncertní sál
Koncertní sál s vynikající akustikou, vhodný pro oratorní a komorní hudbu. Mimořádně kvalitní barokní varhany Andreas Wambetsser, klavír Bösendorfer, jednomanuálové cembalo Lindholm, dvojmanuálové cembalo Ammer.
Kapacita sálu: 400 míst + 5 míst pro invalidní vozíky. Sál je temperován.
Malý koncertní sál
Malý sál je vhodný pro pořádání komorních koncertů a recitálů.
Klavír zn. Petrof. Možnost konání seminářů, prezentací, tiskových konferencí.
Kapacita sálu: 50 míst, sál je temperován.